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Identificación in silico de micrornas y sus dianas en la lenteja
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| En este trabajo se adopta el enfoque in silico para la identificación y caracterización de miRNAs conservados en etiquetas de secuencia expresada (ESTs) de lentejas. Para la identificación de nuevos miRNAs en lentejas, las secuencias EST se buscaron por homología contra miRNAs maduros conocidos del reino vegetal Viridiplantae a través de BLASTN en línea. La identificación computacional basada en la genómica comparativa dio como resultado 12 potenciales miRNAs candidatos pertenecientes a 12 familias diferentes de miRNAs en lenteja. Finalmente, utilizando los potenciales miRNAs del ajo, se predijo un total de 25 genes diana y se ilustraron sus probables funciones. La mayoría de los genes diana de miARN de lenteja parecen codificar el crecimiento, el desarrollo, el metabolismo y la respuesta al estrés, la resistencia a enfermedades, etc. En un futuro próximo, una mejor comprensión de los mecanismos moleculares de los miRNAs en la planta de lenteja puede ayudar en el desarrollo de técnicas novedosas y precisas para comprender algunos mecanismos de silenciamiento génico post-transcripcional en respuesta a la tolerancia al estrés. |
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